📊 계산 결과
항체 필요 부피:
0.5 ml
1M Sodium bicarbonate:
50 μL (0.050ml)
Biotin 필요량:
0.01 mg
Biotin 첨가량 (5mg/ml):
5 μL (0.005ml)
📋 프로토콜 단계
1
항체 2 mg/ml 0.5 mL + 1M Sodium bicarbonate (NaHCO₃) 50 μL
2
Biotin (Thermo, 5mg/ml in DMSO) 5.0 μL 첨가
📄 텍스트 파일로 저장
📋 클립보드에 복사
🔄 초기값으로 재설정
📊 계산 결과
100mM Na-phosphate 버퍼:
계산됨
HNa2O4P:
7.1 g
H2NaO4P:
2.1 g
📋 프로토콜 단계
1
Streptavidin 10 mg 을 1mM Sodium carbonate buffer pH 9.6에 녹여 10mg/ml로 제조
📄 텍스트 파일로 저장
📋 클립보드에 복사
🔄 초기값으로 재설정
📊 계산 결과
스케일 비율:
1.0배
계산된 Bead volume:
50 μL (0.050 ml)
Protocol 1 DDW:
265.1 μL (0.265 ml)
Protocol 2 MES buffer:
450 μL (0.450 ml)
📋 프로토콜 단계 (6단계)
1
Pre-washing:
• 0.5M MES, 50mM MES 50 μL
• Dark-red bead 50 μL
• 2mg/ml NHS 110.5 μL
• 1mg/ml EDC 24.4 μL (vortexing 중 첨가)
• DDW 265.1 μL
• Final volume 500 μL
→ Vortexing 900rpm, RT, 30min
→ Centrifuge 14000rpm, 15min, 4℃, 상층액 제거
2
Ab conjugation:
• 남은 bead volume: 50 μL
• Ab 50 μg (final conc. 100μg/ml)
• 50mM MES 450 μL
• Final volume 500 μL
→ Bead + 50mM MES 혼합 후 sonication
→ Vortexing 하면서 Ab 첨가
→ Vortexing 900rpm, RT, 1h 30min
→ Centrifuge 14000rpm, 15min, 4℃, 상층액 제거
3
Washing 1:
• 50mM Tris-Cl, 1% BSA 1.00 mL
→ Sonication
→ Centrifuge 14000rpm, 15min, 4℃, 상층액 제거
4
Washing 2:
• 50mM Tris-Cl, 1% BSA 1.00 mL
→ Sonication
→ Centrifuge 14000rpm, 15min, 4℃, 상층액 제거
5
Washing 3:
• 50mM Tris-Cl, 1% BSA 1.00 mL
→ Sonication
→ Vortexing 900rpm, RT, 30min
→ Centrifuge 14000rpm, 15min, 4℃, 상층액 제거
6
Stock:
• 남은 bead volume 측정
• 50mM Tris-Cl, 1% BSA로 final volume 500 μL 까지 조정
→ Sonication
📄 텍스트 파일로 저장
📋 클립보드에 복사
🔄 초기값으로 재설정
📊 제조 계산 결과
1M Sodium bicarbonate 첨가량:
100 μL
Dye 첨가량 (1ml당 20μL):
20 μL
총 Dye 양:
0.1 mg
📈 OD 측정 및 계산
측정
280.00nm
650.00nm
OD1
OD2
AVG
2.08
9.52
🧮 계산 결과 (Equations 2-4)
Protein conc. (mg/ml ) - Eq.2:
1.54 mg/ml
Protein conc. (M) - Eq.3:
1.03E-5 M
DOL (moles dye/mole protein) - Eq.4:
4.50
M ratio:
0.00
Conjugation ratio:
4.50
📋 프로토콜 단계 (5단계)
1
Protein 준비:
• Protein 2 mg/ml 1.0 ml 준비
• 1M sodium bicarbonate(pH 8.5±0.5) 100 μL 첨가하여 100mM이 되게 조정
2
Dye 첨가:
• Dye 20 μL 천천히 첨가 (1ml당 20μL)
• 반응이 갑자기 일어나지 않게 천천히 진행
• 항체 1mg당 dye 0.1mg 비율 (1:0.05 or 1:0.1)
3
반응:
• 전체를 호일로 차광
• 저온(창고)에서 overnight 교반
4
정제:
• Column으로 정제
• 전날 Sephadex를 미리 swelling해놓고 냉장보관
• Volume에 맞는 column으로 진행
5
정량 및 분석:
• 280nm에서 정량
• OD₂₈₀, OD₆₅₀ 측정
• Equations 2-4를 사용하여 DOL 및 conjugation ratio 계산
📄 텍스트 파일로 저장
📋 클립보드에 복사
🔄 초기값으로 재설정